Địa bàn xã Mỹ Đức trước đây là một phần xã Đạ Tẻh thuộc huyện Đạ Huoai.

Ngày 6 tháng 3 năm 1984, Hội đồng Bộ trưởng ban hành Quyết định 38-HĐBT[4]. Theo đó, chia xã Đạ Tẻh thành hai xã An Nhơn và Hà Đông.

Ngày 6 tháng 6 năm 1986, Hội đồng Bộ trưởng ban hành Quyết định 67-HĐBT[1]. Theo đó, chia xã Hà Đông thành ba xã Hà Đông, Mỹ Đức và Quốc Oai.

Cùng ngày, huyện Đạ Huoai được chia thành 3 huyện: Đạ Huoai, Đạ Tẻh và Cát Tiên[5]; các xã Hà Đông và Mỹ Đức chuyển sang trực thuộc huyện Đạ Tẻh mới thành lập.

Trước khi sáp nhập, xã Mỹ Đức có diện tích 104,10 km², dân số là 3.992 người, mật độ dân số đạt 38 người/km². Xã Hà Đông có diện tích 4,41 km², dân số là 1.736 người, mật độ dân số đạt 394 người/km².

Ngày 17 tháng 12 năm 2019, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của xã Hà Đông vào xã Mỹ Đức.[2]